MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022661	TCG	2	6	43	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022661	ACGG	2	8	107	114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022661	A	6	6	116	121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022661	GCGTT	2	10	261	270	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022661	GC	3	6	271	276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022661	GTT	3	9	318	326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022661	T	7	7	325	331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022661	GT	3	6	333	338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022661	T	6	6	338	343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022661	ACA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022661	CAA	2	6	402	407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022661	ATG	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022661	A	6	6	476	481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022661	AAC	2	6	512	517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579582
15	NC_022661	GAA	2	6	553	558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556579582
16	NC_022661	AGA	2	6	563	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556579582
17	NC_022661	GCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556579582
18	NC_022661	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556579582
19	NC_022661	A	6	6	783	788	100 %	0 %	0 %	0 %	556579582
20	NC_022661	TTAG	2	8	793	800	25 %	50 %	25 %	0 %	556579582
21	NC_022661	ACA	2	6	863	868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579582
22	NC_022661	GCA	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556579582
23	NC_022661	CAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556579582
24	NC_022661	GCC	2	6	1036	1041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022661	GCC	2	6	1089	1094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_022661	ACC	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022661	GC	3	6	1280	1285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022661	CCT	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022661	GAC	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022661	AAC	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022661	ACA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022661	CGC	2	6	1461	1466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.